| 各キャラ１回だけ１２種類のジョブから自由に選択できる。もちろん選ばなくてもいいが、一度決定したらそれ以降は変えることはできないので慎重に選ばなくてはならない。またジョブごとに習得できるライセンスの種類が異なる。ジョブは今まで選択していなければライセンスからいつでも選択できる。 | |
|---|---|
| トライアル | 全100戦を連続で戦うここで得たアイテムはストーリー上に持ち込めないが、逆は可能。つまりストーリーモードのセーブデータを使って挑戦できるということ。途中１０戦ごとにセーブ可能（セーブはトライアル専用のデータとしてセーブされる）。 |
| ミストナックゲージはＭＰではなくなった | タイトルの通りミストナックとＭＰは別のものとされ、ＭＰがＭＡＸでなくても使えたりする。 |
| ガンビットがいきなりほぼ全てそろう | 最初の店でほとんど全て買えるようになった。その他のアイテムも種類が増えた |
| 召喚獣の操作が可能に | 召喚獣が自分で操作できるようになったため必殺技を自分の好きなタイミングで出せるようになった。 |
| トレジャーのランダム性廃止 | 一回目に取る時のアイテムが固定された。２回目以降はランダム。 |
| ゲストキャラを操作可能 | 今回はゲストキャラも操作可能になりガンビットも設定可能。 |
| ハイスピードモード | Ｌ１ボタンでハイスピードモードにできるので時間の短縮が可能。 |
| 強くてニューゲーム | １回クリアーするとレベル９０で開始できる。 |
| アイテムの一部が変更 | 気付け薬→ン・カイの砂 目覚まし時計→王子の口づけ ワクチン→C9H804 クロノスの涙がスロウにも効くようになった 新しくソレイユの牙（範囲内の敵に火属性のダメージ）が加わった |
| 魔法の一部が変更 | リバースとデコイが裏魔法→緑魔法に プロテスとシェルが緑魔法→白魔法 スリプルとブラインが緑魔法→黒魔法に ウォータ→アクアに名称変更 アーダーが黒魔法→裏魔法に タクシクが緑魔法→黒魔法に |